提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
美股回落纳指跌1.59%,亚马逊跌超8%******
中新经纬2月4日电 美东时间周五,美三大股指低开后冲高回落,截至收盘集体飘绿,纳指盘中一度跌近2%。
截至收盘,道指跌0.38%报33926.01点,本周累跌0.15%;纳指跌1.59%报12006.96点,本周累涨3.31%;标普500指数跌1.04%报4136.48点,本周累涨1.62%。
盘前,美国劳工部发布的数据显示,1月非农就业人数增加51.7万人,为2022年7月以来最大增幅,预估为增加19万人,前值为增加22.3万人。据媒体报道,由于就业数据非常强劲,市场可能预期,这会降低美联储停止加息的速度。
盘面上,美股大型科技股多数下跌,苹果涨2.44%,亚马逊跌8.43%,奈飞跌0.27%,谷歌跌2.75%,脸书跌1.19%,微软跌2.36%。
消息面上,苹果、亚马逊、谷歌等科技巨头业绩表现不佳。亚马逊发布的财报显示,2022年,亚马逊净亏损达27亿美元,创该公司历史最差,上年净利润为333.64亿美元;净销售额约5140亿美元,同比增长9%。
美股银行股多数上涨,摩根大通涨1.51%,高盛涨0.1%,花旗跌1.53%,摩根士丹利涨0.18%,美国银行涨0.83%,富国银行涨0.72%。
美股航空股全线走低,波音跌1.59%,美国航空跌0.23%,达美航空跌0.85%,西南航空跌1.29%,美联航跌2.27%。
热门中概股普遍下跌,雾芯科技跌12.25%,亿航智能跌11.05%,斗鱼跌9.28%,虎牙直播跌8.13%,万国数据跌6.93%,知乎跌6.17%,BOSS直聘跌6.17%,亚朵跌6.01%,百度跌5.44%,微博跌5.39%,腾讯音乐跌5.29%,哔哩哔哩跌5.18%;涨幅方面,趣店涨6.15%。
中概新能源汽车股集体下跌,蔚来汽车跌6.44%,小鹏汽车跌4.98%,理想汽车跌5.96%。
欧股方面,英国伦敦股市《金融时报》100种股票平均价格指数3日报收于7901.80点,比前一交易日上涨81.64点,涨幅为1.04%;法国巴黎股市CAC40指数报收于7233.94点,比前一交易日上涨67.67点,涨幅为0.94%;德国法兰克福股市DAX指数报收于15476.43点,比前一交易日下跌32.76点,跌幅为0.21%。
纽约商品交易所黄金期货市场交投最活跃的4月黄金期价3日比前一交易日下跌54.2美元,收于每盎司1876.6美元,跌幅为2.81%。
纽约油价3日显著下跌,3月交货的纽约轻质原油期货价格下跌2.49美元,收于每桶73.39美元。
美元指数3日大幅上涨,截至纽约汇市尾盘,衡量美元对六种主要货币的美元指数上涨1.16%至102.9340。(中新经纬APP)
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